Αίτια
Τα αίτια του συνδρόμου είναι ακόμα ασαφή. Σημαντικό ρόλο παίζει συχνά η αντίσταση στην ινσουλίνη. Οι γυναίκες αυτές υπερπαράγουν ινσουλίνη, η οποία ευθύνεται για την αυξημένη έκκριση ανδρογόνων, με αποτέλεσμα τα ωάρια να αποτυγχάνουν να ωριμάσουν και να μην υπάρχει ωοθυλακιορρηξία.

Αλλαγή τρόπου ζωής
Δεδομένου ότι το σύνδρομο PCO συνδέεται συχνά με την παχυσαρκία και την αντίσταση στην ινσουλίνη, η αλλαγή του τρόπου ζωής, δηλαδή μία ισορροπημένη διατροφή και η αυξημένη άσκηση, επιφέρει ένα θετικό αποτέλεσμα.

Φαρμακευτική αντιμετώπιση
Στην περίπτωση ανωοθυλακιορρηκτικών κύκλων, ορισμένοι γιατροί συνιστούν τη χορήγηση φαρμάκων (γοναδοτροπινών). Αυτά έχουν τη δυνατότητα πολλαπλής ωοηθυλακιορηξίας. Σε ορισμένες περιπτώσεις η λήψη φαρμάκων συνδυάζεται με τη χορήγηση μετφορμίνης, η οποία διατηρεί τα επίπεδα της ινσουλίνης στο αίμα στα φυσιολογικά επίπεδα.

Χειρουργική αντιμετώπιση
Η κύρια αιτία της ανωοθυλακιορρηξίας σε γυναίκες που πάσχουν από πολυκυστικές ωοθήκες είναι η πάχυνση του φλοιού και του όγκου των ωοθηκών. Μπορεί να αντιμετωπιστεί χειρουργικά με λαπαροσκόπηση, όπου γίνεται διάτρηση του φλοιού των ωοθηκών (drilling). Μετά από αυτή την επέμβαση η λειτουργία των ωοθηκών τείνει προς το φυσιολογικό και ξεκινάει η φυσιολογική διαδικασία της ωοθυλακιορηξίας.