Τα αίτια της υπογονιμότητας είναι πολυάριθμα και συχνά οφείλονται σε ένα σύνολο διαφορετικών παραγόντων.
Ορμονικές διαταραχές, δυσπλασίες στις ωοθήκες, στις σάλπιγγες και τη μήτρα, ενδομητρίωση, σύνδρομο Πολυκυστικών Ωοθηκών, ινομυώματα της μήτρας, Ολιγοσπερμία, αζωοοσπερμία, διαταραχές σεξουαλικής φύσεως, ενώ υπάρχουν και άλλοι παράγοντες ανοσολογικοί και γενετικοί.